17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1455 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1455  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  688    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  39.27 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  36.52 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0152  hypothetical protein  35.26 
 
 		 404 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  32.49 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  32 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  32.27 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  32.25 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0633  hypothetical protein  28.13 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4418  hypothetical protein  27.41 
 
 		 372 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3442  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  40.62 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5028  hypothetical protein  24.33 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  22.83 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  23.02 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  30.6 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  22.6 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3986  hypothetical protein  38.6 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.077735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>