18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1050 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  573  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  39.13 
 
 
331 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0268  NERD domain protein  34.82 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  30.97 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  35.71 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  40.68 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  32.86 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  40.98 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  40.68 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  40.68 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  40 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  22.14 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  21.77 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  37.29 
 
 
212 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  25.91 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  33.33 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  35.94 
 
 
259 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>