21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0462 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0462  hypothetical protein  100 
 
 
530 aa  1095    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.369233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4458  hypothetical protein  51.37 
 
 
458 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4495  hypothetical protein  51.61 
 
 
489 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.394846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5810  hypothetical protein  43.54 
 
 
442 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00960319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2729  hypothetical protein  38.74 
 
 
476 aa  266  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.585762  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0272  hypothetical protein  30.81 
 
 
418 aa  169  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  23.3 
 
 
401 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  23.67 
 
 
400 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  23.64 
 
 
415 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0947  hypothetical protein  30.97 
 
 
512 aa  57.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  22.77 
 
 
401 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  22.17 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  27.68 
 
 
475 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  26.67 
 
 
473 aa  55.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  47.92 
 
 
559 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  22.55 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  24.42 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0983  hypothetical protein  27.31 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2000  hypothetical protein  25.12 
 
 
418 aa  52  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  37.08 
 
 
499 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  22.19 
 
 
403 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>