20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1413 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1591  hypothetical protein  68.09 
 
 
581 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  58.33 
 
 
54 aa  63.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0733  hypothetical protein  58.7 
 
 
47 aa  62.8  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.818237 
 
 
-
 
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  53.33 
 
 
46 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0871  hypothetical protein  66.67 
 
 
57 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0980  hypothetical protein  64.44 
 
 
57 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0205462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  51.06 
 
 
55 aa  60.5  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  56.82 
 
 
49 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1250  hypothetical protein  51.11 
 
 
46 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141622  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  55.32 
 
 
49 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1628  hypothetical protein  47.5 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0890036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  54.76 
 
 
49 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  48.94 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0936  hypothetical protein  56.1 
 
 
51 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0897  hypothetical protein  43.18 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.756039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  52.38 
 
 
55 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  52.5 
 
 
52 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  50 
 
 
50 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  52.38 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>