20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0877 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  214  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  48.51 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  41.82 
 
 		 113 aa  84.3  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  49.4 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  32.26 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  28.24 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  34.57 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  34.94 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  28.24 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  40.38 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  28.09 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  24.62 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  30.12 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  30 
 
 		 215 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>