18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0802 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  100 
 
 		 88 aa  177  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  38.37 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  36.26 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  35.29 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  35.16 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  41.76 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  40.48 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  32.94 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  36.96 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  36.47 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  34.78 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  34.12 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  34.12 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  32.56 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  28.57 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  27.27 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  30.85 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  29.69 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.616696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>