21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0468 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0468  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 119 aa  244  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00208252 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1238  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  34.07 
 
 		 287 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  32.97 
 
 		 287 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 420 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.23 
 
 		 745 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 864 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.71 
 
 		 615 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.45 
 
 		 267 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 448 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.51 
 
 		 577 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 586 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.51 
 
 		 577 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 562 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 254 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1138 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 4079 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 601 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2594  hypothetical protein  27.36 
 
 		 366 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 265 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>