51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0039 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0013  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0809108  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0021  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309299  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0668617 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1466  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000857792  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0439  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000182942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1719  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778292  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0014  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309202  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.083443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309113  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309157  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309082  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.248116  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309081  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0041  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309354  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309355  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.824908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 109 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0061  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122342  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6021  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.893316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0070  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0632642 
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 99 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>