19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3790 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3790  integrase family protein  100 
 
 
408 aa  833    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3518  phage integrase  46.51 
 
 
414 aa  364  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5147  hypothetical protein  47.75 
 
 
423 aa  330  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3025  hypothetical protein  42.58 
 
 
430 aa  298  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3340  hypothetical protein  38.59 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2829  hypothetical protein  37.92 
 
 
435 aa  243  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2801  hypothetical protein  26.94 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0753  tyrosine recombinase XerD subunit  22.81 
 
 
297 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000038176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25 
 
 
440 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.53 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  25.79 
 
 
301 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.79 
 
 
295 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2026  integrase domain protein SAM domain protein  23.47 
 
 
297 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  23.47 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  23.47 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  23.47 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  23.47 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  23.47 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  27.15 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>