10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3340 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2829  hypothetical protein  77.49 
 
 		 435 aa  691    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3340  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  971    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3025  hypothetical protein  50.35 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3790  integrase family protein  39.23 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3518  phage integrase  35.11 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5147  hypothetical protein  37.5 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2801  hypothetical protein  23.78 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  24.16 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 304 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  21.58 
 
 		 301 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>