13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2829 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2829  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  893    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3340  hypothetical protein  77.49 
 
 		 473 aa  692    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3025  hypothetical protein  52.16 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3790  integrase family protein  38.31 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3518  phage integrase  34.22 
 
 		 414 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5147  hypothetical protein  36.28 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2801  hypothetical protein  23.25 
 
 		 452 aa  86.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  23.6 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  23.03 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  21.4 
 
 		 279 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  22.4 
 
 		 306 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  26.87 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>