33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1818 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1818  translation initiation factor eIF-6  100 
 
 
221 aa  431  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0235  translation initiation factor eIF-6  92.76 
 
 
221 aa  377  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0998  translation initiation factor IF-6  71.04 
 
 
221 aa  317  7.999999999999999e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0826  translation initiation factor IF-6  68.78 
 
 
221 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00606754  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1232  translation initiation factor eIF-6  70.59 
 
 
221 aa  300  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1567  translation initiation factor IF-6  49.55 
 
 
221 aa  199  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0459  translation initiation factor IF-6  46.48 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0540  translation initiation factor IF-6  43.44 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000169194  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1968  translation initiation factor IF-6  43.98 
 
 
220 aa  167  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0113  translation initiation factor IF-6  44.71 
 
 
217 aa  165  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1882  translation initiation factor IF-6  42.79 
 
 
220 aa  162  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0937333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3020  translation initiation factor IF-6  41.82 
 
 
221 aa  158  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0028  translation initiation factor eIF-6  37.61 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1478  translation initiation factor IF-6  39.55 
 
 
222 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000242124  hitchhiker  0.000577571 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00650  eukaryotic translation initiation factor 6 (eif-6), putative  37.9 
 
 
245 aa  136  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0199  translation initiation factor IF-6  34.91 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0856043  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1628  translation initiation factor IF-6  34.4 
 
 
223 aa  128  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000860601  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0474  translation initiation factor IF-6  35.81 
 
 
223 aa  126  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08824  translation initiation factor eIF-6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06010)  35.16 
 
 
247 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00475287  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66051  predicted protein  34.53 
 
 
245 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0865921  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0237  translation initiation factor IF-6  34.67 
 
 
221 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0125  translation initiation factor IF-6  33.94 
 
 
227 aa  122  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.079136  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0458  translation initiation factor IF-6  38.86 
 
 
221 aa  122  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0889  translation initiation factor IF-6  35.24 
 
 
227 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1323  translation initiation factor eIF-6  33.18 
 
 
223 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1058  translation initiation factor IF-6  35.24 
 
 
227 aa  121  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1616  translation initiation factor IF-6  35.24 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1662  translation initiation factor IF-6  37.67 
 
 
221 aa  118  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1076  translation initiation factor IF-6  34.22 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1826  translation initiation factor IF-6  36.02 
 
 
221 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.644834 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24493  predicted protein  34.86 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1608  translation initiation factor IF-6  35.07 
 
 
220 aa  112  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119613  eukaryotic translation initiation factor 6  34.29 
 
 
256 aa  109  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.514842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>