16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3797 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3797    100 
 
 		 447 bp  886    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  92.33 
 
 		 681 bp  555  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  80.5 
 
 		 1659 bp  87.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9094    80.5 
 
 		 1660 bp  87.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  80.5 
 
 		 1659 bp  87.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  80.5 
 
 		 1659 bp  87.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  92.86 
 
 		 450 bp  79.8  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3917  hypothetical protein  97.67 
 
 		 837 bp  77.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  87.72 
 
 		 1662 bp  58  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4967    92.68 
 
 		 372 bp  58  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3065  hypothetical protein  90.24 
 
 		 966 bp  50.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.012759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  88.89 
 
 		 1608 bp  50.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3947    88.64 
 
 		 231 bp  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  100 
 
 		 321 bp  46.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  91.43 
 
 		 1386 bp  46.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  91.43 
 
 		 1689 bp  46.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>