More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3480 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
314 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  90.13 
 
 
314 aa  568  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  85.99 
 
 
314 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  86.12 
 
 
317 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  87.03 
 
 
316 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  84.71 
 
 
314 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  87.03 
 
 
316 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.28 
 
 
314 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.2 
 
 
309 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.17 
 
 
309 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.23 
 
 
309 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.41 
 
 
313 aa  407  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.55 
 
 
309 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.2 
 
 
309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.2 
 
 
349 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.65 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.55 
 
 
309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.93 
 
 
319 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.58 
 
 
309 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.97 
 
 
308 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.56 
 
 
309 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  66.56 
 
 
309 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.52 
 
 
310 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.56 
 
 
309 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.23 
 
 
309 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  67.63 
 
 
311 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  64.52 
 
 
309 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.1 
 
 
309 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  68.28 
 
 
308 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  66.67 
 
 
309 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.91 
 
 
309 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.77 
 
 
317 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.01 
 
 
316 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.96 
 
 
308 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.73 
 
 
316 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.77 
 
 
313 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
310 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0457  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
310 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3168  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
310 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7938  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.64 
 
 
315 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256052  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1038  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.55 
 
 
309 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.434498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3272  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.2 
 
 
311 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
309 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.97 
 
 
313 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  65.91 
 
 
309 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.5 
 
 
317 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.43 
 
 
308 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  368  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.71 
 
 
309 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.4 
 
 
308 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.99 
 
 
311 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
313 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.31 
 
 
311 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.94 
 
 
309 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.17 
 
 
310 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  60.32 
 
 
310 aa  362  4e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.75 
 
 
308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.81 
 
 
310 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2426  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.88 
 
 
309 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.31 
 
 
311 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  65.58 
 
 
309 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.31 
 
 
311 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.87 
 
 
309 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.87 
 
 
309 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
310 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.02 
 
 
311 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.31 
 
 
311 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
310 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.63 
 
 
311 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  64.63 
 
 
311 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.63 
 
 
311 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.86 
 
 
312 aa  359  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.63 
 
 
311 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.63 
 
 
311 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.31 
 
 
311 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.63 
 
 
311 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.29 
 
 
309 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.63 
 
 
311 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.31 
 
 
311 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.5 
 
 
317 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.16 
 
 
310 aa  359  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.87 
 
 
308 aa  358  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  63.99 
 
 
311 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.31 
 
 
311 aa  358  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.13 
 
 
308 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.31 
 
 
311 aa  358  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0216  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.1 
 
 
308 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.97 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.67 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.94 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.22 
 
 
315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.21 
 
 
314 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.68 
 
 
309 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0545  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.06 
 
 
308 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  64.01 
 
 
314 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  60.12 
 
 
327 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.26 
 
 
310 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.96 
 
 
307 aa  350  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.59 
 
 
307 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.86 
 
 
311 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>