24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2817 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2422  hypothetical protein  86.24 
 
 		 109 aa  191  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0667358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  64.52 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  63.44 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  55.43 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0193  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  48.35 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0178  hypothetical protein  44.12 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0184  hypothetical protein  47.25 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  37.89 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.71 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.67 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.69 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.71 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.73 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 93 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  32.35 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  32.35 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  32.35 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  32.35 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>