27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1652 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  99.7 
 
 		 531 bp  658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  99.7 
 
 		 531 bp  658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1652    100 
 
 		 336 bp  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  100 
 
 		 531 bp  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  100 
 
 		 531 bp  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1136    100 
 
 		 505 bp  446  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0294064  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4150    99.5 
 
 		 1234 bp  387  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  89.71 
 
 		 959 bp  79.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0606    89.71 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2412    89.71 
 
 		 952 bp  79.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3285    89.71 
 
 		 952 bp  79.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.930868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  88.24 
 
 		 531 bp  71.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  88.24 
 
 		 531 bp  71.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  88.24 
 
 		 531 bp  71.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  88.24 
 
 		 531 bp  71.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  89.29 
 
 		 567 bp  63.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  78.53 
 
 		 955 bp  54  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  92.11 
 
 		 852 bp  52  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  86.79 
 
 		 944 bp  50.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  86.79 
 
 		 944 bp  50.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  93.94 
 
 		 958 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  91.67 
 
 		 477 bp  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  91.67 
 
 		 477 bp  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  91.67 
 
 		 477 bp  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  91.67 
 
 		 477 bp  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  91.67 
 
 		 477 bp  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  91.67 
 
 		 477 bp  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>