29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1333 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1149    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  46.39 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  74.39 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  46.15 
 
 		 535 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  48.62 
 
 		 535 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  48 
 
 		 535 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  47.81 
 
 		 525 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  34.87 
 
 		 597 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  34.79 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  34.45 
 
 		 597 aa  228  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  34.76 
 
 		 599 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  32.27 
 
 		 587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  31.88 
 
 		 588 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  35.22 
 
 		 602 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  40.79 
 
 		 497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  35.22 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  28.8 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0716  flagellar hook-associated protein FlgL  33.58 
 
 		 303 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  30.83 
 
 		 304 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3169  flagellar hook-associated protein FlgL  30.07 
 
 		 302 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247991 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  26.35 
 
 		 297 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0769  flagellar hook-associated protein FlgL  29.84 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  24.22 
 
 		 335 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0875  flagellar hook-associated protein FlgL  24.49 
 
 		 303 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  27.22 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  26.99 
 
 		 336 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  28 
 
 		 304 aa  43.9  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  28 
 
 		 304 aa  43.5  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1986  response regulator receiver domain-containing protein  26.8 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>