More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5179 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  100 
 
 
283 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  72.73 
 
 
285 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  56.02 
 
 
335 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  52.94 
 
 
310 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  51.49 
 
 
272 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  47.46 
 
 
288 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
291 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  44.64 
 
 
283 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  45.36 
 
 
312 aa  185  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.78 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  39.64 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.73 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  47.15 
 
 
285 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.74 
 
 
278 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  47.13 
 
 
284 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.98 
 
 
284 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  41.13 
 
 
285 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  46.04 
 
 
275 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  47.37 
 
 
270 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.24 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  50.38 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  42.81 
 
 
285 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  45.91 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  45.49 
 
 
272 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 
276 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  45.08 
 
 
281 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  49.23 
 
 
282 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.38 
 
 
284 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  43.23 
 
 
284 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  46.59 
 
 
291 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.35 
 
 
299 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  43.17 
 
 
295 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  42.8 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.05 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  44.98 
 
 
375 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.13 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  43.77 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  46.32 
 
 
627 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  43.13 
 
 
289 aa  171  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  48.71 
 
 
299 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  44.15 
 
 
289 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.64 
 
 
284 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  41.83 
 
 
290 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  45.28 
 
 
289 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.28 
 
 
289 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.28 
 
 
289 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  44.91 
 
 
276 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  48.12 
 
 
298 aa  168  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  41.32 
 
 
284 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  41.73 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  40.6 
 
 
284 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  34.08 
 
 
276 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  39.03 
 
 
276 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  40.6 
 
 
284 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  39.57 
 
 
282 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  37.98 
 
 
278 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
271 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  42.91 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  44.7 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  42.46 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  39.3 
 
 
284 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  46.69 
 
 
282 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  35.96 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  41.01 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  41.01 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  41.01 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  44.87 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  41.01 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.36 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  41.01 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.79 
 
 
287 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
272 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  37.97 
 
 
272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.37 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  42.28 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  35.93 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  43.1 
 
 
289 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  42.39 
 
 
305 aa  162  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  36.33 
 
 
277 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  45.56 
 
 
282 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  36.19 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  35.56 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  36.19 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  36.19 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 
284 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
283 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  35.58 
 
 
277 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.57 
 
 
284 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.51 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  47.39 
 
 
283 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  45.7 
 
 
278 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  35.32 
 
 
277 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.14 
 
 
292 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  38.35 
 
 
285 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  43.01 
 
 
297 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.93 
 
 
290 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 
284 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>