25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5099 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  54.42 
 
 
1448 aa  1234    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  100 
 
 
1584 aa  3038    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.962428 
 
 
-
 
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  28.64 
 
 
1376 aa  198  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  30.44 
 
 
1404 aa  179  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  30.44 
 
 
1404 aa  179  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  38.33 
 
 
1354 aa  155  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  35.74 
 
 
1366 aa  141  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  39.19 
 
 
1347 aa  138  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  27.3 
 
 
1365 aa  135  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  36.47 
 
 
1411 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  36.95 
 
 
1443 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  30.92 
 
 
1367 aa  124  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  26.98 
 
 
1388 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  26.52 
 
 
1350 aa  122  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  28.24 
 
 
1376 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  28.95 
 
 
1353 aa  112  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  29.02 
 
 
1404 aa  110  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  26.34 
 
 
1370 aa  92.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  30 
 
 
1425 aa  86.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  35.39 
 
 
1406 aa  85.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  57.53 
 
 
1427 aa  84  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  47.83 
 
 
1409 aa  72.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  46.53 
 
 
1387 aa  71.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  23.57 
 
 
1109 aa  50.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  29.52 
 
 
1228 aa  50.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>