21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4766 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  46.86 
 
 
278 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  47.62 
 
 
274 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  48.65 
 
 
274 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  42.68 
 
 
257 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  40.33 
 
 
247 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  45.34 
 
 
251 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  39.18 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  38.75 
 
 
249 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  36.68 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  32.81 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  36.36 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  36.21 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  34.98 
 
 
273 aa  79  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  31.72 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  33.59 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  28.46 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  28.09 
 
 
285 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  28.36 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  28.67 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1027  hypothetical protein  28.73 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>