35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3324 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3324  band 7 protein  100 
 
 		 607 aa  1234    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2148  band 7 protein  70.87 
 
 		 538 aa  729    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2982  hypothetical protein  56.94 
 
 		 536 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688388  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0385  hypothetical protein  54.58 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.747749  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2147  band 7 protein  30.16 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.235634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3323  band 7 protein  27.13 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2981  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  29.23 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0384  band 7 protein  27.83 
 
 		 411 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  26.6 
 
 		 315 aa  54.3  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.91 
 
 		 281 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.88 
 
 		 296 aa  48.5  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  22.56 
 
 		 326 aa  48.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  24.82 
 
 		 283 aa  47.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0057  band 7 protein  22.73 
 
 		 295 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.28 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  30.38 
 
 		 266 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.77 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  23.66 
 
 		 284 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  23.66 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  22.9 
 
 		 284 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.66 
 
 		 316 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  22.6 
 
 		 435 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.05 
 
 		 322 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  26.05 
 
 		 322 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  26.05 
 
 		 322 aa  44.3  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  26.05 
 
 		 322 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.29 
 
 		 311 aa  43.9  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  26.05 
 
 		 321 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  22.53 
 
 		 477 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  25.64 
 
 		 310 aa  43.9  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  23.29 
 
 		 311 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.05 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.05 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  27.84 
 
 		 351 aa  43.5  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.29 
 
 		 311 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>