79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0054 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0008  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0057  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0014  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0007  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0056  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0009  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 67 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0056  tRNA-Thr  85.33 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00110  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00090  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0114532  normal  0.0453152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  86 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  86 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  86 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  86 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0048  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798887  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0029  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0048  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000131085  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0007  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  86 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0015  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0544479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0024  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0700552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>