90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0051 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0017  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0007  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0062  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0006  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168855  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0057  tRNA-Thr  85.25 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0048  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna54  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0043  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0048  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000810946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0070  tRNA-Ala  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0035  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0890141  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0012  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0009  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 67 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0030  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>