29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0007 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0057  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0008  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0014  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0054  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0007  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0056  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000134541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_872  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000166459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0030  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000291549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0024  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0700552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0009  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 67 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0005  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 1080 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00265781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0048  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000131085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0007  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0032  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.386226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0058  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00100  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0012  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>