10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4405 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4405  putative lipoprotein  100 
 
 		 454 aa  880    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  27.51 
 
 		 636 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  31.93 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  30.73 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 634 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  32.62 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  32.62 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  30.2 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  30.14 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  31.33 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>