15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2386 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1553  hypothetical protein  64.71 
 
 
582 aa  693    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3775  hypothetical protein  71.97 
 
 
613 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464348  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1498  hypothetical protein  64.89 
 
 
582 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2386  ATPase-like protein  100 
 
 
589 aa  1191    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000327253  hitchhiker  0.000621551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  64.99 
 
 
578 aa  739    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4029  ATPase-like protein  64.18 
 
 
580 aa  667    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  45.74 
 
 
585 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1662  hypothetical protein  46.48 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1417  hypothetical protein  46.05 
 
 
606 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0731587  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  40.81 
 
 
571 aa  406  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6133  ATPase-like protein  40.1 
 
 
630 aa  353  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.869987  normal  0.698643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  32.84 
 
 
611 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  32.84 
 
 
611 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0452  hypothetical protein  27.81 
 
 
682 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  24.69 
 
 
1071 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>