26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1486 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  367  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09170  hypothetical protein  38.73 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5987  hypothetical protein  42.62 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  37.59 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  36.23 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4218  hypothetical protein  37.18 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19108  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2149  hypothetical protein  34 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1930  hypothetical protein  35.45 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.900616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  38.32 
 
 
141 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  40.17 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  35.88 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1910  hypothetical protein  32.39 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1976  hypothetical protein  32.39 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524667  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2109  hypothetical protein  33.77 
 
 
204 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2840  hypothetical protein  38.6 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  42.68 
 
 
174 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  44.44 
 
 
145 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  42.42 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3208  hypothetical protein  30.51 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  38.89 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  32.21 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1679  hypothetical protein  30.83 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0785238  hitchhiker  0.00456336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1273  hypothetical protein  27.72 
 
 
229 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170661  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2309  hypothetical protein  37.61 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000375151  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1596  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0390754  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1365  secreted protein  56.82 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866634  normal  0.409644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>