174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0269 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0269  urease, beta subunit  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0698  urease, beta subunit  62.39 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0950057  hitchhiker  0.000000034878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3410  urease, beta subunit  67.31 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2806  urease, beta subunit  58.25 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0478999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2850  urease, beta subunit  58.25 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2833  urease, beta subunit  58.25 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2756  urease, beta subunit  56.31 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3083  urease, beta subunit  56.31 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  59.18 
 
 		 231 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.16 
 
 		 231 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11877  urease subunit beta  55.34 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0622972  normal  0.383269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  57.45 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  58.76 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  58.76 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1497  urease subunit beta  58.76 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  57.45 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  57.73 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  59.79 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  57.43 
 
 		 231 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  55.67 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3353  urease, beta subunit  54.37 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.880629  normal  0.518335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  57.14 
 
 		 231 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  54.64 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  56.38 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  54.64 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  54.74 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  55.32 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  54.26 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  57.73 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  57.89 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  55.32 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  56.38 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  56.38 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.81 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  57.45 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  53.61 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  52.13 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  57.45 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  55.32 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  54.74 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1322  urease subunit beta  52.13 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  56.38 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  55.32 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  56.38 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  53.61 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  56.38 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  51.82 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  55.79 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  55.32 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  55 
 
 		 206 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  56.38 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  55.67 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  56.84 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  57.45 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  55.67 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  54.26 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  55.32 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  55.79 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5694  urease, beta subunit  55.88 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  55.32 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  56.38 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  56.38 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1209  urease, beta subunit  55.34 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  55.67 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  55.67 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  55.67 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  55.67 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  55.67 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  53.06 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  46.81 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3075  urease subunit beta  54.64 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  51.55 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  53.19 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  54.74 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  52.63 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  54.26 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  53.68 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  53.68 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  53.19 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  55.67 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  54.26 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  52.58 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  52.58 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  53.19 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  53.61 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.76 
 
 		 248 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  54.74 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0190  urease, beta subunit  53.19 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  50 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  53 
 
 		 206 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  50 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  51.55 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  51.06 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  53.19 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  52.13 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  51.06 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  51.06 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  52.63 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  50 
 
 		 206 aa  93.6  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  52.13 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>