16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0051 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0051  Rv0623 family protein transcription factor  100 
 
 		 84 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4578  Rv0623-like transcription factor  55.42 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1343  Rv0623-like transcription factor  53.57 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8286  Rv0623 family protein transcription factor  57.65 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3943  Rv0623-like transcription factor  49.41 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00539695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1446  Rv0623-like transcription factor  47.06 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4619  Rv0623 family protein transcription factor  44.94 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4798  transcription factor  43.68 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11758  hypothetical protein  45.59 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0450063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0246  Rv0623-like transcription factor  41.18 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10634  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000344549  normal  0.468408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0632  transcription factor  43.75 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10619  hypothetical protein  38.1 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000401564  normal  0.419389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1870  transcription factor  39.19 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173194  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6312  Rv0623 family protein transcription factor  34.88 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2862  hypothetical protein  54.76 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>