24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3070 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  100 
 
 
253 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  90.12 
 
 
253 aa  440  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  80 
 
 
244 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  76.47 
 
 
256 aa  353  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  80 
 
 
244 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  80 
 
 
244 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  66.67 
 
 
255 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  52.16 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  42.79 
 
 
225 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  36.4 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  37.17 
 
 
247 aa  99  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  40.11 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  36.02 
 
 
289 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  44.37 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  35.36 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  34.62 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  38.71 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  38.71 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  38.71 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  36.28 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  31.03 
 
 
223 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  20.46 
 
 
234 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  25.27 
 
 
271 aa  42  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>