21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0256 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  34.63 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1225  prenyltransferase  33.5 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  31.19 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  28.44 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  26.94 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2435  prenyltransferase  27.23 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1569  UbiA prenyltransferase  27.22 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  25.1 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  26.64 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  27.31 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1001  hypothetical protein  28.39 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  27.97 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2064  UbiA prenyltransferase  28.82 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  23.62 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  26.23 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  29.85 
 
 		 577 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0368  hypothetical protein  25.46 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1812  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  30.81 
 
 		 580 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2658  UbiA prenyltransferase  38.89 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  24.08 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>