More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3494 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0697  cell division protein FtsA  72.5 
 
 
438 aa  649    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505091  normal  0.501331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3494  cell division protein FtsA  100 
 
 
438 aa  876    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.815355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7437  cell division protein FtsA  63.36 
 
 
441 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.05738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3175  cell division protein FtsA  62.67 
 
 
440 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0332764  normal  0.87705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3132  cell division protein FtsA  62.44 
 
 
440 aa  544  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48829  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2351  cell division protein FtsA  62.21 
 
 
440 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6698  cell division protein FtsA  62.44 
 
 
441 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2948  cell division protein FtsA  62.53 
 
 
419 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576909  normal  0.0698479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0327  cell division protein FtsA  55.96 
 
 
441 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740051  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2075  cell division protein FtsA  53.81 
 
 
442 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  52.31 
 
 
441 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  51.85 
 
 
443 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2587  cell division protein FtsA  52.08 
 
 
443 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  56.13 
 
 
440 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  55.9 
 
 
440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  55.9 
 
 
440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4041  cell division protein FtsA  50.46 
 
 
440 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6167  cell division protein ATPase  49.89 
 
 
439 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2002  cell division protein FtsA  53.72 
 
 
437 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0360528  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1057  cell division protein FtsA  49.54 
 
 
440 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2003  cell division protein FtsA  49.43 
 
 
441 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.302134  normal  0.480609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1285  cell division protein FtsA  49.07 
 
 
440 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3299  cell division protein FtsA  48.61 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3387  cell division protein FtsA  49.88 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2426  cell division protein FtsA  46.56 
 
 
436 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116428  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  46.81 
 
 
432 aa  381  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2072  cell division protein FtsA  43.35 
 
 
443 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.327697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  46.29 
 
 
437 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0945  cell division protein FtsA  40.84 
 
 
440 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000880063  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2417  cell division protein  40.28 
 
 
445 aa  302  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000659549  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0688  cell division protein FtsA  40.78 
 
 
450 aa  302  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0260143  decreased coverage  0.000277221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3165  cell division protein FtsA  40.41 
 
 
464 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0699  cell division protein FtsA  38.23 
 
 
444 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181959  normal  0.281367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2113  cell division protein FtsA  38 
 
 
444 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0789  cell division protein FtsA  38 
 
 
444 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150702  normal  0.197586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2751  cell division protein FtsA  41 
 
 
444 aa  279  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.411174  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3658  cell division protein FtsA  40.97 
 
 
441 aa  279  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4488  cell division protein FtsA  38.02 
 
 
444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00787322  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1090  cell division protein FtsA  36.73 
 
 
415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  35.45 
 
 
411 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  35.92 
 
 
411 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  33.65 
 
 
417 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0876  cell division protein FtsA  35.15 
 
 
411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  34.98 
 
 
411 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  34.51 
 
 
411 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  35.45 
 
 
411 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3941  cell division protein FtsA  34.81 
 
 
419 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2448  cell division protein FtsA  34.46 
 
 
411 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3284  cell division protein FtsA  35.85 
 
 
412 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000382408  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00905  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
420 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  36.79 
 
 
411 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  35.86 
 
 
410 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  35.86 
 
 
410 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  35.86 
 
 
410 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1976  cell division protein FtsA  32 
 
 
420 aa  237  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000208947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  35.18 
 
 
412 aa  235  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2086  cell division protein FtsA  34.59 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0360839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004487  cell division protein FtsA  32.47 
 
 
420 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000664411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  34.38 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00095  cell division protein  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000325229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3506  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3383  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
418 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000224319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3563  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000026867  normal  0.0140898 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00094  hypothetical protein  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0087  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000920666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0100  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.5263e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0102  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000385207  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0099  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000243315  normal  0.662552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0096  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000450452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3514  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
418 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00728683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2914  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
418 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00100679  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1876  cell division protein FtsA  33.67 
 
 
418 aa  233  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0652  cell division protein FtsA  34.2 
 
 
418 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00954622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  36.68 
 
 
423 aa  232  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0614  cell division protein FtsA  33.49 
 
 
418 aa  232  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.009675  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0166  cell division protein FtsA  32.1 
 
 
412 aa  232  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0665  cell division protein FtsA  33.88 
 
 
411 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000156077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4461  cell division protein FtsA  31.73 
 
 
411 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4669  cell division protein FtsA  34.37 
 
 
419 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165844  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0148  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000465462  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0144  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0165123  hitchhiker  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0852  cell division protein FtsA  34.62 
 
 
409 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000127132  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0141  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0011437  normal  0.628842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0149  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000205082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0144  cell division protein FtsA  33.1 
 
 
420 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000104465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0765  cell division protein FtsA  32.7 
 
 
418 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000001661  normal  0.370373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  34.21 
 
 
418 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  34.89 
 
 
409 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  34.21 
 
 
418 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0640  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
418 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000505976  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0948  cell division protein FtsA  34.28 
 
 
418 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2783  cell division protein FtsA  33.73 
 
 
407 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
410 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
410 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>