More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3319 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2785  amino acid adenylation domain-containing protein  42.76 
 
 		 1370 aa  954    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  39.44 
 
 		 2626 aa  680    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  37.15 
 
 		 2878 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5730  peptide synthetase  44.81 
 
 		 1327 aa  1063    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1347  amino acid adenylation domain-containing protein  47.39 
 
 		 1000 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3319  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 1343 aa  2713    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.020024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  37.91 
 
 		 4037 aa  655    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4808  amino acid adenylation domain protein  50.15 
 
 		 1329 aa  1284    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  38.13 
 
 		 5230 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  38.26 
 
 		 2189 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  38.87 
 
 		 5467 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  38.13 
 
 		 3208 aa  595  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  39.51 
 
 		 2651 aa  593  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  35.5 
 
 		 5213 aa  582  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  35.91 
 
 		 6176 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  34.64 
 
 		 5328 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.12 
 
 		 1801 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  37.85 
 
 		 4136 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.24 
 
 		 3470 aa  562  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  36.44 
 
 		 5654 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  38.18 
 
 		 5149 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.34 
 
 		 4336 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  34.51 
 
 		 4991 aa  552  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  33.81 
 
 		 3942 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  34.99 
 
 		 1138 aa  545  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.31 
 
 		 4332 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.87 
 
 		 4336 aa  539  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 		 2845 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.98 
 
 		 4317 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  34.47 
 
 		 4317 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.45 
 
 		 4342 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.89 
 
 		 4317 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.36 
 
 		 4342 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  33.45 
 
 		 4317 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.67 
 
 		 2033 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  34.94 
 
 		 1110 aa  519  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.08 
 
 		 3291 aa  519  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 		 6661 aa  516  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  35.62 
 
 		 1732 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.75 
 
 		 1776 aa  513  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4038  amino acid adenylation domain-containing protein  35.12 
 
 		 1659 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0287  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.62 
 
 		 1732 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0997015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0874  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.62 
 
 		 1732 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  35.81 
 
 		 1739 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  33.95 
 
 		 3331 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1943  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  35.56 
 
 		 1741 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4073  amino acid adenylation domain protein  35.8 
 
 		 1674 aa  506  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  35.51 
 
 		 1675 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1161  amino acid adenylation  36.48 
 
 		 1662 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1641  amino acid adenylation domain-containing protein  36.48 
 
 		 1662 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1624  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.65 
 
 		 1732 aa  506  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1928  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  35.49 
 
 		 1745 aa  506  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361647  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  32.95 
 
 		 2867 aa  502  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.42 
 
 		 4502 aa  503  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.11 
 
 		 3086 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  34.51 
 
 		 4747 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  32.58 
 
 		 2571 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4787  amino acid adenylation  35.74 
 
 		 1663 aa  499  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  32.09 
 
 		 2448 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  32.58 
 
 		 2571 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1597  amino acid adenylation domain-containing protein  36.03 
 
 		 1658 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  31.11 
 
 		 3086 aa  496  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.93 
 
 		 3308 aa  495  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  30.68 
 
 		 3235 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1559  amino acid adenylation domain-containing protein  36.02 
 
 		 1669 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203226  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1538  amino acid adenylation domain-containing protein  36.02 
 
 		 1670 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.46 
 
 		 4318 aa  489  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  32.88 
 
 		 2561 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  34.03 
 
 		 2155 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.58 
 
 		 2370 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.28 
 
 		 1839 aa  489  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.11 
 
 		 6889 aa  485  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.5 
 
 		 2151 aa  486  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.39 
 
 		 4531 aa  486  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  29.02 
 
 		 1336 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  34.83 
 
 		 1199 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  32.34 
 
 		 7712 aa  486  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.68 
 
 		 6676 aa  486  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  32.23 
 
 		 1142 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.76 
 
 		 3498 aa  486  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  31.3 
 
 		 1786 aa  485  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  31.18 
 
 		 2581 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  28.38 
 
 		 1833 aa  485  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  29.67 
 
 		 1556 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  32.43 
 
 		 1114 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  29.77 
 
 		 1556 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 6403 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  30.19 
 
 		 2156 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.08 
 
 		 2156 aa  479  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1616  amino acid adenylation domain-containing protein  36.12 
 
 		 1665 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0177803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  35.1 
 
 		 2125 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.76 
 
 		 1331 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  34 
 
 		 2174 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.85 
 
 		 5953 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.83 
 
 		 8646 aa  476  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.56 
 
 		 1789 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.03 
 
 		 2385 aa  476  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  32.46 
 
 		 2154 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.69 
 
 		 2385 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  32.6 
 
 		 6006 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>