19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3084 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3084  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 623 aa  1262    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.7 
 
 		 677 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  27.67 
 
 		 564 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  29.21 
 
 		 632 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  28.29 
 
 		 566 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  28.9 
 
 		 669 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  28.46 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  28.24 
 
 		 669 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1985  hypothetical protein  25.24 
 
 		 711 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3643  hypothetical protein  25 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  23.34 
 
 		 629 aa  64.3  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  23.03 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  23.03 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.64 
 
 		 256 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  23.94 
 
 		 600 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4708  hypothetical protein  30.97 
 
 		 888 aa  44.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00825046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2834  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 166 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>