41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2678 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  100 
 
 		 418 aa  857    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  62.29 
 
 		 418 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  61.34 
 
 		 418 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  61.34 
 
 		 418 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  61.34 
 
 		 418 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  61.34 
 
 		 418 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  62.68 
 
 		 418 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  62.44 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  62.44 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  62.44 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  62.44 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  62.44 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  62.44 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  62.44 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  61.58 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  49.08 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  50.55 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  47.85 
 
 		 408 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  45.63 
 
 		 404 aa  352  8e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.71 
 
 		 404 aa  348  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  46.7 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  46.7 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  45.66 
 
 		 384 aa  328  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  44.23 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  43.68 
 
 		 658 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  40.58 
 
 		 477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  42.9 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  38.69 
 
 		 407 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  36.07 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  42.71 
 
 		 234 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  26.18 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  22.64 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  26.14 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  28.03 
 
 		 224 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  28.03 
 
 		 211 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  28.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  28.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  28.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  28.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  28.03 
 
 		 211 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>