57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1036 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1036  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 		 112 aa  208  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0560094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1583  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  67.57 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.98 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  49.52 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.27 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.45 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.55 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.88 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1396  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.54 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.46 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.61 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.32 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.98 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.69 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1639  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.03 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  36.19 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.16 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.18 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.52 
 
 		 130 aa  48.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.88 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.72 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  30.93 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.660845  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01570  hypothetical protein  34.18 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.55 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2485  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.05 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5268  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.88 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1041  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.85 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.371299  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0876  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.85 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000659238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1780  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.85 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.52 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.13 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.273986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.25 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0938  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.45 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.16 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0554454  normal  0.387715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2762  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.16 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.45 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.96 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479151  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.74 
 
 		 114 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2850  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.84 
 
 		 123 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3146  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.48 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35450  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  33 
 
 		 158 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.975038 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0031  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.78 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3856  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  39.58 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.44 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0675  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  40.38 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2620  putative Na+/H+ antiporter  40.43 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.63 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2475  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.41 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  0.278156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1385  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.41 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.57 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  35.96 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0149  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  43.18 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5102  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.78 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1009  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.08 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0960292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3129  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  36.36 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3290  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  33.71 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>