More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0475 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 345 aa  687    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.27 
 
 		 343 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  67.75 
 
 		 356 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  69.07 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.07 
 
 		 343 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.77 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  69.37 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  59.76 
 
 		 342 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  57.44 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  58.68 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  59.35 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  58.86 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  57.96 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  58.48 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  57.66 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  60.48 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.36 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  54.05 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  58.59 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  56.36 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  34.41 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.95 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.65 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  34.09 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  35.24 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  34.45 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  33.64 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  36.48 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.21 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.24 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  33.98 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.66 
 
 		 378 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  33.66 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  32.83 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  35.35 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.64 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.65 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  33.66 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.55 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.75 
 
 		 305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  36.31 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  36.58 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  32.48 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  32.48 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  31.79 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  33.66 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  30.34 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  35.56 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  33.66 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  34.86 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  33.33 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  36.31 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  33.01 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  31.23 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.54 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  34.68 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  30.89 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  31.07 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  31.91 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  32.45 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  33.62 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.64 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  31.35 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.25 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.31 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  32.83 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.76 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  31.08 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  34.09 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  32.12 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  29.91 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  34.42 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.8 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  32.69 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  32.14 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.95 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.35 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.06 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  32.72 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.58 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  31.6 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.86 
 
 		 329 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  32.76 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  35.52 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  37.13 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  32.45 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  31.27 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.7 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.45 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  32.45 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.02 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  30.86 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  37.13 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  31.56 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  32.45 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  30.84 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  32.79 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  37.13 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  32.74 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  35.78 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>