20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0405 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0405  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 477 aa  966    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.878783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5525  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.16 
 
 		 463 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3302  glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.98 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  27.37 
 
 		 619 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  26.2 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0465  hypothetical protein  26.42 
 
 		 435 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  27.01 
 
 		 661 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33726  Glucoamylase GLU1 precursor (Glucan 1,4-alpha-glucosidase) (1,4-alpha-D-glucan glucohydrolase)  22.84 
 
 		 560 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02630  glucan 1,4-alpha-glucosidase, putative  26.24 
 
 		 577 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5985  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.88 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  24.14 
 
 		 621 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  23.11 
 
 		 645 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  23.37 
 
 		 621 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  24.32 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  24.12 
 
 		 615 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  22.97 
 
 		 670 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  23.27 
 
 		 668 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  25.66 
 
 		 650 aa  44.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  23.18 
 
 		 622 aa  43.5  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 		 644 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>