33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0110 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  100 
 
 		 402 aa  828    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  71.11 
 
 		 405 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  53.42 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  49.88 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  49.88 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.13 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  47.55 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  45.95 
 
 		 418 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  46.57 
 
 		 418 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  45.32 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  45.71 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  45.71 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  45.71 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  45.86 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  45.86 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  45.86 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  45.86 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  45.86 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  45.86 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  45.86 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  44.52 
 
 		 418 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  44.5 
 
 		 418 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  47.74 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.14 
 
 		 658 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  46.56 
 
 		 384 aa  335  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  44.48 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  40.43 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  39.01 
 
 		 407 aa  262  8.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  37.9 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  48.31 
 
 		 234 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  26.18 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  23.13 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  27.02 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>