126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1968 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1968  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
336 aa  687    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1682  phosphate uptake regulator, PhoU  49.25 
 
 
336 aa  338  9e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1069  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1765  hypothetical protein  34.01 
 
 
336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  32.05 
 
 
348 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0495  phosphate uptake regulator, PhoU  29.97 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2476  phosphate uptake regulator, PhoU  30.79 
 
 
331 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1545  phosphate uptake regulator, PhoU  29.64 
 
 
332 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2356  phosphate uptake regulator, PhoU  30.79 
 
 
334 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1425  phosphate uptake regulator, PhoU  29.88 
 
 
335 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3440  phosphate uptake regulator, PhoU  29.18 
 
 
331 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0447  phosphate uptake regulator, PhoU  32.65 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000672536  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1393  phosphate uptake regulator, PhoU  32.25 
 
 
335 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0620  phosphate uptake regulator, PhoU  29.33 
 
 
336 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0944  phosphate uptake regulator, PhoU  33.76 
 
 
337 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2950  putative regulatory protein  33.1 
 
 
293 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11037  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1794  phosphate uptake regulator, PhoU  28.01 
 
 
332 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0479748 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0860  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 
339 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.198015 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1119  hypothetical protein  28.66 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0479  phosphate uptake regulator, PhoU  29.12 
 
 
337 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1926  phosphate uptake regulator, PhoU  30.86 
 
 
330 aa  132  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0897  phosphate uptake regulator, PhoU  26.93 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.247428  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0914  phosphate uptake regulator, PhoU  28.27 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2400  phosphate uptake regulator, PhoU  27.33 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.282043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3128  hypothetical protein  27.48 
 
 
304 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0353  phosphate uptake regulator, PhoU  28.32 
 
 
350 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0896452  normal  0.250975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2363  phosphate uptake regulator, PhoU  27.09 
 
 
344 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0595  phosphate uptake regulator, PhoU  23.33 
 
 
335 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1065  phosphate uptake regulator, PhoU  26.91 
 
 
316 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1622  SpoVT/AbrB domain-containing protein  26.56 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00903094  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0693  phosphate uptake regulator, PhoU  21.43 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571595  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  29.57 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0358933 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1329  phosphate uptake regulator, PhoU  26.62 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.445187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1597  SpoVT/AbrB domain protein  25 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.755665  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1109  SpoVT/AbrB domain-containing protein  23.72 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.235676  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0312  phosphate uptake regulator, PhoU  21.68 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1386  phosphate uptake regulator, PhoU  20.06 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2336  phosphate uptake regulator, PhoU  21.8 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.119502  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2335  phosphate uptake regulator, PhoU  19.82 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1600  phosphate uptake regulator, PhoU  24.76 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1831  phosphate uptake regulator, PhoU  23.4 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000208314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2081  phosphate uptake regulator, PhoU  24.9 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0893566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1015  phosphate uptake regulator, PhoU  24.51 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.313422 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3556  SpoVT/AbrB domain protein  23.29 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  26.73 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  36.04 
 
 
225 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1287  phosphate uptake regulator, PhoU  22.78 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1883  hypothetical protein  26.64 
 
 
277 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.85602 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0430  SpoVT/AbrB domain protein  27.16 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 
242 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 
241 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  32.65 
 
 
216 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 
241 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  22.44 
 
 
217 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 
236 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  23.04 
 
 
215 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1904  SpoVT/AbrB domain protein  24.12 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365247  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1659  SpoVT/AbrB domain-containing protein  21.28 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.724868  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.18 
 
 
235 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  23.74 
 
 
222 aa  49.3  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  33.72 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  36.47 
 
 
243 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.63 
 
 
227 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  37.63 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  28.1 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  32.22 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  26.7 
 
 
548 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.43 
 
 
553 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  32.29 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  25.13 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  32.56 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 
229 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  29.89 
 
 
220 aa  46.6  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  30.69 
 
 
218 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  33.71 
 
 
217 aa  46.2  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  31.4 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  30.69 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.69 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  32.58 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.58 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.15 
 
 
576 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  30.11 
 
 
237 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  30 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.29 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  31.33 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.69 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  26.36 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  32.29 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.69 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0507  SpoVT/AbrB domain-containing protein  22.13 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.134191  normal  0.166881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  28.36 
 
 
240 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  31.33 
 
 
237 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  28.92 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.24 
 
 
226 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>