172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1260 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  70.22 
 
 		 548 aa  704    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  74.31 
 
 		 553 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  78.98 
 
 		 556 aa  846    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  80.04 
 
 		 576 aa  862    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  74.36 
 
 		 552 aa  788    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  78.61 
 
 		 556 aa  845    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  100 
 
 		 553 aa  1096    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  74.77 
 
 		 577 aa  800    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  60.11 
 
 		 559 aa  631  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  54.48 
 
 		 563 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  53.39 
 
 		 558 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  53.76 
 
 		 565 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  51.4 
 
 		 582 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  50.92 
 
 		 562 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  50.64 
 
 		 582 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  52.96 
 
 		 561 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  50.65 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  48.8 
 
 		 552 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  49.17 
 
 		 550 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.1 
 
 		 552 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.8 
 
 		 552 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.28 
 
 		 552 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.8 
 
 		 552 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  48.98 
 
 		 550 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  48.79 
 
 		 543 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  48.51 
 
 		 543 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  48.6 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  48.6 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  47.94 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  48.31 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  47.94 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  48.6 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  47.94 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  47.94 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  47.75 
 
 		 546 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  48.6 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  48.6 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  48.6 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  48.6 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  47.94 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  47.37 
 
 		 548 aa  458  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  48.03 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  47.66 
 
 		 543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.43 
 
 		 548 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  43.96 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.95 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  42.59 
 
 		 565 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  45.81 
 
 		 568 aa  399  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.98 
 
 		 565 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.14 
 
 		 601 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.08 
 
 		 548 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  42.41 
 
 		 553 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  37.08 
 
 		 548 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  33.94 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  34.85 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  35.6 
 
 		 558 aa  323  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  37.43 
 
 		 561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  34.84 
 
 		 560 aa  320  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.15 
 
 		 547 aa  320  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.23 
 
 		 548 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  35.24 
 
 		 558 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.23 
 
 		 548 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.57 
 
 		 562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  41.24 
 
 		 561 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  35.79 
 
 		 578 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  41.31 
 
 		 564 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  40.93 
 
 		 561 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  32.43 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.43 
 
 		 542 aa  263  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  37.71 
 
 		 555 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  31.65 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  37.39 
 
 		 555 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.49 
 
 		 567 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.38 
 
 		 563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.94 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.05 
 
 		 558 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.65 
 
 		 556 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  28.63 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  25.24 
 
 		 537 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  24.67 
 
 		 537 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.22 
 
 		 643 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.2 
 
 		 539 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.81 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  24.59 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  24.22 
 
 		 551 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  24.13 
 
 		 551 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  24.31 
 
 		 551 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.73 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.75 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  24.04 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  24.04 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  24.04 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  24.13 
 
 		 551 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  24.13 
 
 		 544 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.31 
 
 		 541 aa  177  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.13 
 
 		 551 aa  177  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.86 
 
 		 536 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.27 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.49 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.58 
 
 		 541 aa  170  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>