146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1901 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1901  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
96 aa  182  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00687805  normal  0.0793607 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1304  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  65.91 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1740  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  34.78 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1554  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  34.78 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000262612  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1435  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  38.2 
 
 
104 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1920  NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  33.7 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00149289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.23 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.42 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  34.74 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  34.74 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  36.36 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  36.36 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.26 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  34.02 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  37.5 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  34.02 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  36.36 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  35.23 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0931  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.64 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  35.23 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  34.02 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.23 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  35.42 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  31.25 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  30.21 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2928  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.77 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0402  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.33 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  30.21 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.63 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  29.17 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  31.25 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36.78 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0851  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.5 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132836  hitchhiker  0.000000191003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.48 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  35.42 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  35.42 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  35.42 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  34.48 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  31.18 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0938  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.508582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1042  NADH dehydrogenase subunit K  34.74 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  hitchhiker  0.00000310035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.82 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1013  NADH dehydrogenase subunit K  34.74 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  33.7 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.96 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  30.21 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.11 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  33.33 
 
 
113 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.29 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.68 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.68 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  34.09 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.52 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  26.67 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  34.09 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.18 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  34.09 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.26 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.82 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.08 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  32.56 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.05 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.56 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.56 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  27.96 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  27.96 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  27.96 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  32.56 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  30.11 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3404  F420H2 dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143705  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  27.96 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  35.23 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  28.12 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.78 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0757  NADH dehydrogenase subunit K  33.7 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.588315  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  26.44 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  27.08 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.03 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  28.12 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1012  NADH dehydrogenase I, K subunit  31.25 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0553  NADH dehydrogenase I, K subunit  32.98 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.719312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30.68 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  26.04 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1032  NADH dehydrogenase subunit K  34.09 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  31.4 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.37 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  28.12 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0900  NADH dehydrogenase subunit K  32.95 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252714  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4623  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.23 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0763865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  28.12 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  28.12 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2388  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.36 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00132006  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0399  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  35.23 
 
 
101 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  35.23 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>