More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0851 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0851  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
133 aa  260  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132836  hitchhiker  0.000000191003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  59.43 
 
 
156 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  59.29 
 
 
128 aa  129  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  55.45 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.76 
 
 
106 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.5 
 
 
118 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
102 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0402  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  58.33 
 
 
127 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.75 
 
 
105 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0938  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.14 
 
 
110 aa  94.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.508582 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  58.24 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
101 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  56.18 
 
 
107 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1363  NADH dehydrogenase subunit K  51.04 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  59.76 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  55.06 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.33 
 
 
107 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1271  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
102 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0495478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  48.39 
 
 
97 aa  90.5  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  59.76 
 
 
106 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50.54 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1726  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.88 
 
 
101 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.08 
 
 
102 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  57.61 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.88 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  60.98 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  60.98 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.52 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  60.98 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.92 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0900  NADH dehydrogenase subunit K  48.96 
 
 
102 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252714  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
102 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.33 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2413  NADH dehydrogenase subunit K  51.06 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0788  NADH dehydrogenase (quinone), K subunit  47.87 
 
 
102 aa  87.8  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0860266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3246  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0807  NADH dehydrogenase I, K subunit  52.17 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
102 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0757  NADH dehydrogenase subunit K  53.26 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.588315  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  53.41 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  59.76 
 
 
109 aa  87.4  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
102 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.96 
 
 
102 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  52.69 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0812  NADH dehydrogenase subunit K  51.06 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.907264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.88 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  51.09 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  52.69 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.09 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  47.92 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.17 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.12 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1032  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  58.54 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  44.19 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  49.48 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  48.96 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  44.19 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  48.96 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1075  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.54 
 
 
101 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1204  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.54 
 
 
101 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.54 
 
 
101 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  49 
 
 
104 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  52.69 
 
 
104 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4400  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.96 
 
 
101 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.83 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.81 
 
 
99 aa  83.6  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.88 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2928  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.17 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  47.92 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  52.69 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.9 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  52.69 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  52.69 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4136  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.96 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.19 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  52.69 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  46.88 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.32 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  52.69 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  49.47 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  48.94 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  51.61 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.42 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  51.61 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.58 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  51.61 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.84 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  48.94 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.42 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.25 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  53.68 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>