21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0592 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0592  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 875 aa  1711    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.725449  normal  0.911146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0993  conserved hypothetical protein  46.73 
 
 		 969 aa  655    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1636  hypothetical protein  35.26 
 
 		 761 aa  307  5.0000000000000004e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.210403 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1005  hypothetical protein  30.77 
 
 		 788 aa  105  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1764  hypothetical protein  29.35 
 
 		 791 aa  98.6  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0673103  decreased coverage  0.000629319 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1743  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 		 851 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378968  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0573  hypothetical protein  22.49 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.687596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0263  hypothetical protein  22.27 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1670  hypothetical protein  22.17 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1296  hypothetical protein  21.66 
 
 		 547 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.229034  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1638  hypothetical protein  21.41 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  21.82 
 
 		 428 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  23.91 
 
 		 389 aa  56.6  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1702  S-layer-like domain-containing protein  25.41 
 
 		 467 aa  55.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0283293  normal  0.57018 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1667  hypothetical protein  20.63 
 
 		 642 aa  54.7  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1699  S-layer-like domain-containing protein  24.45 
 
 		 437 aa  52.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.235123 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1529  hypothetical protein  25.67 
 
 		 866 aa  52.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1058  S-layer-like domain-containing protein  23.44 
 
 		 450 aa  51.2  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214671  normal  0.146764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1061  S-layer-like domain-containing protein  25.97 
 
 		 436 aa  47.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3704  S-layer-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 824 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2326  S-layer-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 431 aa  45.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.419836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>