30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0003 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0009  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0049  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.866993  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0034  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0040  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0202702  normal  0.855024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0018  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0039  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0054  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0040  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0006  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0012  tRNA-Gln  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0010  tRNA-Gln  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>