16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6349 on replicon NC_010509
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010509  Mrad2831_6349  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  44.98 
 
 
1449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  46.74 
 
 
1716 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  46.74 
 
 
1457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  40.53 
 
 
442 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  39.33 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3226  domain of unknown function DUF1738  38.07 
 
 
178 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.60789  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9875  hypothetical protein  31.52 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  37.74 
 
 
569 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0005  hypothetical protein  32.61 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0031  hypothetical protein  32.38 
 
 
453 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6318  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0059  hypothetical protein  31.43 
 
 
453 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0062  hypothetical protein  30.48 
 
 
453 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8988  hypothetical protein  44.68 
 
 
358 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
658 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>