174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3903 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3903  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 504 aa  987    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2973  glucan biosynthesis protein D  62.03 
 
 		 558 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3081  glucan biosynthesis protein G  59.88 
 
 		 558 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2855  glucan biosynthesis protein G  60.68 
 
 		 558 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  41.5 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  42.02 
 
 		 559 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  41.32 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  42.86 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  40.81 
 
 		 498 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  41.09 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  41.01 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  41.09 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  43.27 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  37.62 
 
 		 546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 		 544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  38.37 
 
 		 522 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  41.47 
 
 		 540 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  41.22 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  40.79 
 
 		 525 aa  301  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  40.84 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  40.84 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  40.84 
 
 		 542 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  40.84 
 
 		 542 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  42.48 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  42.8 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  41.15 
 
 		 545 aa  297  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 		 604 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  37.82 
 
 		 558 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  37.52 
 
 		 562 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  37.7 
 
 		 604 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  37.52 
 
 		 562 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  37.52 
 
 		 608 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  37.52 
 
 		 562 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  38.97 
 
 		 504 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  36.63 
 
 		 568 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  40.2 
 
 		 533 aa  292  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  41.58 
 
 		 542 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  37.62 
 
 		 594 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  39.96 
 
 		 520 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  37.85 
 
 		 505 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  38.84 
 
 		 588 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  39.76 
 
 		 530 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  41.72 
 
 		 539 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  41.07 
 
 		 528 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  36.11 
 
 		 533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  36.44 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  41.12 
 
 		 539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 		 543 aa  283  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  40.7 
 
 		 560 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  40.24 
 
 		 519 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  34.92 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  34.92 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  34.92 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  34.92 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  34.99 
 
 		 517 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  34.99 
 
 		 517 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  40.35 
 
 		 514 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  39.24 
 
 		 534 aa  279  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  34.72 
 
 		 511 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  34.79 
 
 		 517 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  34.72 
 
 		 511 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  35.32 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  35.32 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  35.32 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  35.32 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  38.29 
 
 		 511 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  35.32 
 
 		 517 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  38.96 
 
 		 517 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  35.52 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  35.52 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  38.36 
 
 		 522 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  37.4 
 
 		 534 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 527 aa  272  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  40 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  38.86 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  36.85 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  34.92 
 
 		 522 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  40.87 
 
 		 519 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  34.33 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  36.02 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  37.72 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  35.52 
 
 		 522 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  37.1 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  34.33 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  40 
 
 		 508 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  37.67 
 
 		 541 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  40.76 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  36.64 
 
 		 525 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  34.57 
 
 		 604 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  38.32 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  34.46 
 
 		 522 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  35.74 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  36.63 
 
 		 537 aa  257  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  36.44 
 
 		 534 aa  256  8e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  34.04 
 
 		 519 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  33.67 
 
 		 559 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  39.84 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>