30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1032 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  265  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  81.02 
 
 
137 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  80.29 
 
 
137 aa  174  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  80.29 
 
 
137 aa  174  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  75.36 
 
 
138 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  71.74 
 
 
138 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  73.19 
 
 
137 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  71.74 
 
 
137 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  77.05 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  51.97 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  51.97 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  56 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  59.54 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  54.96 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  64.17 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  53.44 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  52.82 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  56.03 
 
 
139 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  56.9 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  38.41 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  35.29 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  45.71 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  46.38 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  34.07 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  43.24 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  38.04 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  38.16 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  34.95 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  38.16 
 
 
205 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  37.18 
 
 
210 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>