45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0529 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  732    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  61.38 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  59.94 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  60.11 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  59.03 
 
 		 384 aa  338  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  56.91 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  45.21 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  42.25 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  35.96 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  35.68 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  35.95 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  37.96 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  35.18 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  34.97 
 
 		 380 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  35.58 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  34.74 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  31.58 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  26.02 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  29.46 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  27.01 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  27.07 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  27.75 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  22.26 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.62 
 
 		 1065 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  23.13 
 
 		 425 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.37 
 
 		 1072 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  23.89 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  21.45 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.14 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3613  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.14 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  28.57 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.14 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.862074 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1787  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.45 
 
 		 621 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.86 
 
 		 1074 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1065 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2535  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.49 
 
 		 1072 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.900385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.27 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.81 
 
 		 1082 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2070  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.62 
 
 		 1029 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0160  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.5 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  23.62 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.55 
 
 		 1040 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.69 
 
 		 1063 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.32 
 
 		 1071 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0582  Carbamoyl-phosphate synthetase large chain domain protein  21.88 
 
 		 618 aa  42.7  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000594141  normal  0.448613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>