28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2609 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 137 aa  268  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  99.27 
 
 		 137 aa  266  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  99.27 
 
 		 137 aa  266  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  76.09 
 
 		 137 aa  153  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  74.64 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  70.29 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  69.57 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  80.72 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  74.59 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  48.91 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  48.18 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  52.8 
 
 		 148 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  58.02 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  55.73 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  51.91 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  55.8 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  56.03 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  53.45 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  49.3 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  40.58 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  36.8 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  44.59 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  43.75 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  34.81 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  35.37 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  36.59 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  36.59 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>